内分泌异常是影响女性不孕的重要原因，同样内分泌障碍也影响男性生育，内分泌疾病是导致男性不育的重要原因之一，由于内分泌失调导致男性不育的疾病有多种，他们可以影响男性的正常发育和生精功能导致男性不育的发生。
男性不育的内分泌疾病包括以下方面：
睾丸内分泌异常的病变
原发性睾丸功能低下，比较常见的有克莱恩弗尔特综合征、放射性损伤、细胞毒素损害、营养不良等;继发性睾丸功能低下,氏综合征、雄激素受体缺乏所表现的男性假两性畸形等。
肾上腺疾病
阿狄森氏病、柯兴氏综合征、女性化肾上腺皮质肿瘤、先天性肾上腺增生症、醛固酮增多症等疾病，均可造成男性不育。
甲状腺疾病
男性不育的内分泌疾病可导致生精功能障碍，使精子数量减少，死精子增多，精干活力下降，同时患者可有性欲低下、阳萎等，而致不育。严重的甲状腺功能低下或甲状腺功能亢进，均可影响功能。甲状腺功能低下时，睾酮合成减少，精子生成受到抑制，并发生性功能紊乱。甲状腺功能亢进时常伴有男性*房发育、性欲减退、阳痿等。
垂体病变
垂体功能亢进，早期可出现性欲增加、体型改变等，继而便发生性欲减退、精液异常、阳痿等并导致不育。垂体功能低下，炎症、手术损伤或放疗破坏垂体，致使垂体功能低下，出现性欲、夫妻生活能力降低，睾丸萎缩，精子生成障碍。垂体肿瘤可使血中催乳素水平升高，干扰LH的分泌而抑制睾丸生精功能及发生阳痿，从而导致男性不育。
柯兴氏综合征
系肾上腺皮质激素分泌过多所致，多见于肾上腺肿瘤。患者有性欲减退、阳萎，血浆睾酮水平低下，睾丸组织萎缩，间质细胞退化，精子生成障碍。