女性系统中的抗原包括来自男性的精液中的抗原(见本页以上部分)和女性自身的卵巢抗原。

1、近年来研究证实，女性道粘膜局部具有产生抗精子抗体的能力。女性道避部产生的抗体及血清中的抗精子抗体均可干扰过程。其机理是：①抗体能促进巨噬细胞的吞噬功能，以便从道清除精子;②适当补体存在的情况下，抗体对精子具有细胞毒性;③局部抗体能干扰精子在道内的能量;④局部抗体能与卵曲细胞的成分发生交叉反应，抑制其发育;⑤正常情况下，局部抗体在选择精子中起重要作用。精液抗原使女性产生免疫反应后，女官并不发生病理变化。性交后，抗体攻击的靶子是进入道中的精子。并且每闪性交进入道中的精子都成为一种自然免疫增强剂，能够使抗精子抗体的效价维持在高水平上，从而持久地影响受孕能力。

2、女性自身的卵巢抗原主要是卵巢的特异性抗原，它可以对卵巢产生自身抗体，从而导致不排卵，引起不孕。已知在卵巢的全部抗原中，以透明带的免疫性为强。透明带抗原中，以透明带的免疫性为中。透明常抗原产生的透明带抗体不但能封闭透明带上的受体，阻止受精，而且还能抗着床，这也是女性自身免疫引起不孕的主要原因。